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13个免费考研网生物化学问题与解答(花仙子2008、小裴2007 解答)

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小裴2007 发表于 08-1-31 18:54:02 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
免费考研网生物版问题与解答

2008年1月整理

答案全部由:花仙子2008、小裴2007 做出!其他人的解答请看原贴,欢迎讨论。

题1。紧急求助!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!

转载自:http://bbs.freekaoyan.com/viewthread.php?tid=229160
1.哪些蛋白可称为G蛋白?
2.哪些细胞成分消耗ATP?
3.叶绿体.线粒体等细胞器标志性酶是什么?
4.顺式作用援建因子,反式作用援建因子是什么?

1.哪些蛋白可称为G蛋白?
G-protein
They serve as second messengers or transducers of the receptor-initiated response to intracellular elements such as enzymes to initiate an effect. They are also mediators of activated cell-surface receptors and their enzymes or of ion channels.

They are responsible for activating a chain of events that alters the concentration of intracellular signaling molecules such as cyclic AMP and calcium. In turn, these intracellular messengers alter the behaviour of other target proteins within the cell.  
These proteins have a high affinity for guanine nucleotides and hence are named "G" proteins.

http://cancerweb.ncl.ac.uk/cgi-bin/omd?query=G+protein

2.哪些细胞成分消耗ATP?
核糖体、粗面内质网、细胞核、线粒体、叶绿体。

3.叶绿体.线粒体等细胞器标志性酶是什么?
自己看书!

4.顺式作用援建因子,反式作用援建因子是什么?
援建还是元件?请写出英文。

题2。一个微生物问题

转载自:http://bbs.freekaoyan.com/viewthread.php?tid=225369
从一种位置革兰氏阳性菌中分离到一种聚酮类物质,具有很强的杀伤多种革兰氏阳性菌的作用。试设计实验克隆与改物质生物合成相关的基因或基因簇。

聚酮类物质不是蛋白质,但是肯定是细菌中响应的酶合成的。而且聚酮类物质疏水的,应该能够透过细胞膜,分泌到细菌体外,除非聚酮类物质非游离而结合上生物大分子。

这题就是找到这些酶的基因。观察聚酮类物质产生旺时,细菌体内哪些酶的数量多或者活性高。

这不难。如果酮类物质能够透过细胞膜分泌到细菌体外,只要分出不同的条件,将分泌聚酮类物质革兰氏阳性菌与其敏感菌一起氧,何时敏感菌挂得多,那就是分泌聚酮类物质革兰氏阳性菌产生酮类物质的时候,这时破碎细胞,用此时的细胞的蛋白质组的二维电泳图象对比分泌聚酮类物质革兰氏阳性菌不或少产生酮类物质时的细胞的蛋白质组的二维电泳图象对比,总可以找出表达量不同的蛋白质或有些蛋白质没有表达。

这样可能与分泌聚酮类物质对应的蛋白质就调出来了,再用gene knock in 或gene knock out逐个敲就能确定与分泌聚酮类物质对应的蛋白质了,对相关蛋白质测序(可用质谱),然后通过蛋白质序列反推基因序列,再用基因序列到该细菌的基因组文库钓出基因位点,还有RACE,反向PCR等钓出基因的位置和完整序列。

如果多聚酮类物质不能够透过细胞膜分泌到细菌体外,那也没有关系,不同条件破碎细胞,检测细胞内的多聚酮类物质,找到多聚酮类物质最多时的培养条件,与最少时对比蛋白质组。其余相同。

考点:
1。蛋白质组学概念和二维电泳方法;
2。基因克隆方法。
3。蛋白质与其基因的序列关系和确定方法;
4。基因敲除和敲入。

题3。请高手指点一道酶活计算题!

转载自:http://bbs.freekaoyan.com/viewthread.php?tid=227878
请高手指点一道酶活计算题!

某酶制剂经测定含氮量为5%,今称取2克溶解成50ml酶液,取上述酶液0.5ml,在最适条件下与底物反应,10分钟后测得100微克产物,设该酶催化底物反应,每小时产生6微克产物为一个活力单位。请计算:1)1ml酶液所催化的反应速度及其酶活力;2)该酶制剂每毫克蛋白氮和每毫克蛋白质的比活力;3)每克酶制剂的总活力。

请指教,我自己做过了,但不确定是不是正确答案,请高手尽量写清楚计算步骤,谢谢!

一般测定蛋白质比较粗糙的方法是用6.25进行计算。计算公式如下:

蛋白质样品含N(g)×6.25
————————————×100 = 蛋白质(%)
蛋白质样品重(g)
某酶制剂经测定含氮量为5%,即蛋白质样品含N(g)为5%,蛋白质样品重(g)为100%,代入上式算出蛋白质(%),这也就是酶的浓度。

三个问题
1)1ml酶液所催化的反应速度及其酶活力;2)该酶制剂每毫克蛋白氮和每毫克蛋白质的比活力;3)每克酶制剂的总活力。 只有第二问与酶的浓度有关,其余两问只要直接算出酶制剂的实际催化速度,然后折合成题目的酶活力单位即可。

酶液0.5ml,在最适条件下与底物反应,10分钟后测得100微克产物,那木速度是10微克产物/分,折合为“每小时产生6微克产物为一个活力单位”------------即每分钟产生0.1微克产物为一个活力单位,所以此时是100活力单位。
1)1ml酶液所催化的反应速度及其酶活力?
速度和活力单位各加一倍。

2)该酶制剂每毫克蛋白氮和每毫克蛋白质的比活力?
该酶制剂每毫克蛋白氮,自己算,很简单。
每毫克蛋白质的比活力=100活力单位/[(2克*(0.5ml/50ml)*1000)*蛋白质(%)]
*表示乘以

3)每克酶制剂的总活力?
第二问的值乘以2000。

题4。请教一道某名校的考研生化实验设计题

转载自:http://bbs.freekaoyan.com/viewthread.php?tid=175830
泛素(Ub)降解蛋白质是通过三种酶E1,E2,E3实现的。(1)设计实验证明Ub通过共价键连接E1,E2和被降解的蛋白上,不通过共价键连接E3;(2)设计实验利用Ub纯化E1,E2,E3;(3)证明泛素降解蛋白质过程中ATP为必需

谢谢大家帮忙了!

(1)设计实验证明Ub通过共价键连接E1,E2和被降解的蛋白上,不通过共价键连接E3;
这就是考察分离共价结合与非共价结合而已,可以用细胞外体系(也可以用细胞内体系,而后破碎细胞),对于Ub与E1,E2和被降解的蛋白及E3的两两蛋白的共价或非共价体系,按分子量(事先算好)层析,收取蜂尖产物(对应好分子量,确定好具体对象),然后分别进行SDS电泳,一条带的就是两者共价结合,反之为非共价。

(2)设计实验利用Ub纯化E1,E2,E3
细胞内体系,破碎细胞按上步层析后,共价结合的用酶或化学试剂切开,共价结合的加高离子强度,而后在层析或电泳分离。也可亲和层析,Ub共价连在介质共价结合的用酶或化学试剂切开,非共价结合的加高离子强度洗脱。
(3)证明泛素降解蛋白质过程中ATP为必需
用细胞外体系,不供给ATP。或者用细胞内体系,阻断线粒体功能,等待足够长时间。

题5。请教一道生化考研试题

转载自:http://bbs.freekaoyan.com/viewthread.php?tid=179803
获得一新蛋白可能与DNA复制有关,1.证明其是否有关;2.证明是与起始有关还是与延伸有关

谢谢大家帮忙了!
1.证明其是否有关;
细胞内实验用Gene knock in or Gene knock out,看DNA复制是否仍然正常,受到影响,包括不能复制和能复制但是量上有变化,都可以认定新蛋白与DNA复制有关,要在不同条件下测定,比如较高的温度是否出现“热休克”等。

2.证明是与起始有关还是与延伸有关
如果第一步实验证明新蛋白与DNA复制有关。细胞外实验,取新蛋白与起始因子,和延伸因子都加入体系,看看DNA复制能否进行,反应启动后同时除去蛋白与起始因子,看DNA复制是否继续,若继续,新蛋白与DNA复制起始有关。

题6。一个微生物问题

转载自:http://bbs.freekaoyan.com/viewthread.php?tid=225369
从一种位置革兰氏阳性菌中分离到一种聚酮类物质,具有很强的杀伤多种革兰氏阳性菌的作用。试设计实验克隆与改物质生物合成相关的基因或基因簇。

聚酮类物质不是蛋白质,但是肯定是细菌中响应的酶合成的。而且聚酮类物质疏水的,应该能够透过细胞膜,分泌到细菌体外,除非聚酮类物质非游离而结合上生物大分子。

这题就是找到这些酶的基因。观察聚酮类物质产生旺时,细菌体内哪些酶的数量多或者活性高。

这不难。如果酮类物质能够透过细胞膜分泌到细菌体外,只要分出不同的条件,将分泌聚酮类物质革兰氏阳性菌与其敏感菌一起氧,何时敏感菌挂得多,那就是分泌聚酮类物质革兰氏阳性菌产生酮类物质的时候,这时破碎细胞,用此时的细胞的蛋白质组的二维电泳图象对比分泌聚酮类物质革兰氏阳性菌不或少产生酮类物质时的细胞的蛋白质组的二维电泳图象对比,总可以找出表达量不同的蛋白质或有些蛋白质没有表达。

这样可能与分泌聚酮类物质对应的蛋白质就调出来了,再用gene knock in 或gene knock out逐个敲就能确定与分泌聚酮类物质对应的蛋白质了,对相关蛋白质测序(可用质谱),然后通过蛋白质序列反推基因序列,再用基因序列到该细菌的基因组文库钓出基因位点,还有RACE,反向PCR等钓出基因的位置和完整序列。

如果多聚酮类物质不能够透过细胞膜分泌到细菌体外,那也没有关系,不同条件破碎细胞,检测细胞内的多聚酮类物质,找到多聚酮类物质最多时的培养条件,与最少时对比蛋白质组。其余相同。
考点:
1。蛋白质组学概念和二维电泳方法;
2。基因克隆方法。
3。蛋白质与其基因的序列关系和确定方法;
4。基因敲除和敲入。
题7。请教大家一个关于酶的问题!

转载自:http://bbs.freekaoyan.com/viewthread.php?tid=222968
如果问代谢过程中调节酶的四项措施,应该怎样答最全面?
谢谢!

酶的调节:
(1) 别构调节:包括前馈/反馈和能量调节在内,还有别的别构调节;
(2) 共价调节:包括可逆与不可逆修饰,后者主要指酶原活化,前者有磷酸化 腺苷酰化等。
(3) 活化/抑制蛋白对于酶的调节和生物膜对于酶的调节。前者如钙调蛋白,后者如双关酶在结合上生物膜时其活性与未结合时有所不同,也包括了酶的空间定位对其活性的影响;
前三者都是酶的活性调节
(4) 酶的数量调节:包括由于基因表达的调节而使酶的表达量有所不同,还包括酶的降解----------这往往与其他的生物大分子有关,比如蛋白酶体。

沈同 王镜岩 主编 生物化学第二版和 王镜岩 主编 生物化学 第三版 的酶那章给出的四个酶的调节都是酶的活性调节,我把其中的可逆与不可逆修饰合二为一了。书上没有此题完全的现成的解答。

题8。回答“元元2007”的 四个微生物学问题

转载自:http://bbs.freekaoyan.com/viewthread.php?tid=226475
1 请描述一个噬菌体颗粒在长有细菌菌苔的琼脂平板上是如何形成噬菌斑的.(8分)
提示:这题实际上问以下几个问题:(1)噬菌体定义,(2)噬菌斑(phague)定义,(3)噬菌斑(phague)形成的不同的几个时期的特征,就是从噬菌体侵染细菌到裂解的全部的几个过程,即:噬菌体侵染细菌、在细菌体内复制、装配和裂解的各个时期的特征。这些书上都有。这题不是让你描述噬菌斑(phague)的具体形态,而是说明形成噬菌斑(phague)的机理。

这样该会回答了吧。

2 真核微生物和原核微生物的跨膜转运有何区别??(8分)
答:真核微生物:翻译后转运;原核微生物:边翻译边转运。具体叙述信号肽和导肽的特征。

3..在用酪素培养基平板筛选产胞外蛋白酶细菌时,发现在几株菌的菌落周围有蛋白水解圈,是否能仅凭蛋白水解圈与菌落直径比大,就判定该菌株产胞外蛋白酶的能力就大,而选其为高产蛋白酶的菌种,为什么??(10分)
答:酪素: 微生物培养基的氨基酸氮源,由酪蛋白水解得到,常见商品名称为水解酪素或酶解酪素。
酪蛋白水解后富含21种氨基酸,氨基酸种类齐全。 因此常用于制备培养基。
酪素培养基当然富含酪素。酪素 实质就是蛋白质片段,蛋白酶有不同的底物对象,专一性各有不同,有很多蛋白酶不能水解酪素,所以不形成蛋白水解圈。
菌落直径大小表明细菌书目的多少。
蛋白水解圈与菌落直径比大只能说明该种细菌该菌株产胞外的能够水解酪素的蛋白酶的能力大小,而不能仅此就判定该菌株产胞外蛋白酶的能力就大或选其为高产蛋白酶的菌种。

4 请从微生物的分解代谢和产能代谢的角度谈谈微生物的多样性。(10分)
提示:分别叙述微生物的分解代谢和产能代谢的的具体类型,然后说明类型很多非其他生物所具备。

题9。急求“模体”概念

转载自:http://bbs.freekaoyan.com/viewthread.php?tid=99305
急求“模体”概念
很急
谢谢

膜体(motif):一般是指超二级结构(supersecondary structure),若干相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,组成有规则的、在空间上能够识别的二级结构组合体。

详细请看下一楼。

Protein motifs may be defined by their primary sequence or by the
arrangement of secondary structure elements
The term motif is used in two different ways in structural biology. The first refers
to a particular amino-acid sequence that is characteristic of a specific biochemical function.
An example is the so-called zinc finger motif, CXX(XX)CXXXXXXXXXXXXHXXXH, which
is found in a widely varying family of DNA-binding proteins (Figure 1-49). The conserved
cysteine and histidine residues in this sequence motif form ligands to a zinc ion whose
coordination is essential to stabilize the tertiary structure. Conservation is sometimes of a class
of residues rather than a specific residue: for example, in the 12-residue loop between the zinc
ligands, one position is preferentially hydrophobic, specifically leucine or phenylalanine.
Sequence motifs can often be recognized by simple inspection of the amino-acid sequence of
a protein, and when detected provide strong evidence for biochemical function. The protease
from the human immunodeficiency virus was first identified as an aspartyl protease because a
characteristic sequence motif for such proteases was recognized in its primary structure.
The second, equally common, use of the term motif refers to a set of contiguous secondary
structure elements that either have a particular functional significance or define a portion of
an independently folded domain. Along with the functional sequence motifs, the former are
known generally as functional motifs. An example is the helix-turn-helix motif found in many
DNA-binding proteins (Figure 1-50). This simple structural motif will not exist as a stably
folded domain if expressed separately from the rest of its protein context, but when it can be
detected in a protein that is already thought to bind nucleic acids, it is a likely candidate for
the recognition element. Examples of structural motifs that represent a large part of a stably
folded domain include the four-helix bundle (Figure 1-51), a set of four mutually antiparallel
alpha helices that is found in many hormones as well as other types of proteins; the Rossmann
fold, an alpha/beta twist arrangement that usually binds NAD cofactors; and the Greek-key
motif, an all-beta-sheet arrangement found in many different proteins and which topologically
resembles the design found on ancient vases. As these examples indicate, these structural motifs
sometimes are suggestive of function, but more often are not: the only case here with clear
functional implications is the Rossmann fold.

摘自:Gregory A  Petsko, Dagmar Ringe, Protein structure and function,2004 New Science Press Ltd,34.

题10。中国科学院06生化与分子最后一题....求助

转载自:http://bbs.freekaoyan.com/viewthread.php?tid=204596
已知动物培养细胞中的某一基因的表达受紫外线诱导,试设计一些实验来寻找该基因受紫外线调控的顺式作用元件和转录因子.

我简单说一下思路

1。紫外线诱导:有和无的紫外线有关蛋白质和RNA的水平检测-------------对不同状态的细胞粉碎后提取相关的蛋白质和RNA,进行有无和数量的对比,由于不知道是相关的蛋白质和RNA,就做双向电泳,对比有和无的紫外线表达不同的蛋白质;
2。反式因子与顺式元件的相互作用的研究:就是蛋白质与DNA的相互做用,也可以是蛋白质与RNA的相互做用,方法很多---------凝胶阻滞电泳,红外傅立叶,紫外等。
3。确定直接与顺式元件的相互作用后的蛋白质因子(反式因子)后,再用酵母双杂交,噬菌体展示钓取与反式因子相互作用的蛋白质。
4。有关系统生物学的内容(略)。

方法很多,组合起来更多。回答这个问题头两步就够了,作为基因表达调控研究课题来讲要深入做可以到3。4

这样的问题怎没人讨论。。。?

紫外光诱导出的蛋白质很多不是转录因子,所以必须用多出的蛋白质与顺式元件相互作用才能确定。

补充一下

1。真核细胞有核,所以只要用双向电泳分析对比有和无的紫外线的表达后进入细胞核的蛋白质即可,提取细胞核不难,离心即可,不必全细胞蛋白质组对比;
2。要确定该基因的在哪条染色体上;
3。蛋白质相互作用还可以用分子筛层析、共结晶、NMR等。
4。在找顺式元件时可以使用双向电泳分析对比出的蛋白质与酶切后的DNA片段结合筛选之,根本不结合的先去掉;结合了但是不在一条染色体上的也去掉。剩下的蛋白质不好筛了,再换到DNA上,逐个敲掉与“剩下的蛋白质”可以结合的DNA序列,看细胞对于紫外线的影响。

就这样吧。看来这里的人不感兴趣讨论具体问题。

上面说的是不知道具体基因的位点和产物的情况,也就是知道有紫外诱导这回事,其余一概不知的实验思路。可能题目(原题我没有见过)没有这么复杂。

如果题意是已知"这一基因"的具体位置,那么要简单得多,可以对其同一条的DNA上邻近序列中寻找顺式元件,不必再对基因本身定位了,阻滞电泳和敲除片段都会少多得多。这是还可将这个基因克隆出来,表达出产物,以产物作为指标。

最后提醒一句:有很少的转录因子是RNA,这就要用电泳方法分离比较核内的功能RNA。至于这种情况的顺式元件就可以用功能RNA的互补序列去钓取了。如果出现特异电泳带,但是比较弥散,可以用PCR。不过作为试题这种情况不必考虑了。

题11。生物高手帮我看看这几题~谢谢大家!

转载自:http://bbs.freekaoyan.com/viewthread.php?tid=222107
1、生物膜中的类脂属于双亲性分子,根据类脂分子头部截面积的大小,类脂分子可以分为单体、微团、脂双分子层3种形态存在于水中,这句话对吗?

2、植物的细胞膜中含有钠钾泵吗?

帮我看下哈~谢谢大家!

1、生物膜中的类脂属于双亲性分子,根据类脂分子头部截面积的大小,类脂分子可以分为单体、微团、脂双分子层3种形态存在于水中,这句话对吗?

这句话不正确,因为前半句不对!
生物膜中的类脂取决于分子的固有特征,这即包括分子间的相互作用,也包括分子立体几何因素,同时与溶液的性质有关。由于人们对于溶液中的大分子相互作用的理解还不完善,比较实用的是类脂分子的立体几何因素来确定脂质趋向于哪种聚集形态。

后半段:“类脂分子可以分为单体、微团、脂双分子层3种形态存在于水中”,这半句大致正确。

隋森芳 膜分子生物学 高教出版社 2004,263-265。

2、植物的细胞膜中含有钠钾泵吗?
没有。目前的细胞生物学教材是这样说的,至于SCI文献有没有例外,我没有查过。

小分子RNA一般都是抑制或降低基因表达水平的,今年的PNAS就发现有促进基因表达水平的小分子RNA。

题12。为什么细胞利用Ca2+进行细胞内信号传递,而不是其他离子,如Na+呢?
转载自:http://bbs.freekaoyan.com/viewthread.php?tid=222107

很感谢上次你对我的那两个的解答!我这还有一个问题,你若有时间就帮我看下吧,谢谢!
问题是:为什么细胞利用Ca2+进行细胞内信号传递,而不是其他离子,如Na+呢?
请学姐做点简要回答吧,再次谢谢你!

回答(我打字慢,所以只是提示,全面回答请看书):
在 沈 同、王镜岩 主编 生物化学(上 )高教出版社 ,1990,第450页。
1。细胞内Ca2+的浓度可以大幅度变化。
2。带负电的氧Glu和Asp侧链)和不带电的氧(主链羰 基上)都能很好地结合与Ca2+。Ca2+具有和多个配体结合的能力,能和一个蛋白质的不同的片段结合使他结合的片段发生铰链,并诱导蛋白质发生巨大的构象改变。Ca2+具有有高度的选择性。

以下连接来自生物软件网( http://www.bio-soft.net )
沈 同、王镜岩 主编 生物化学(上 )高教出版社 ,1990
下载:http://www.foodmate.net/lesson/09/1.pdf
沈 同、王镜岩 主编 生物化学(下 )高教出版社 ,1991
下载:http://www.foodmate.net/lesson/09/2.pdf

同时我回复了短信,因为我暂时把下载的英文电子书都关了。。。

题13。热稳定的酶

转载自:http://bbs.freekaoyan.com/viewthread.php?tid=93630
想请教一下 如果纯化一个热稳定的酶是不是就不需要低温条件了?

谢谢!

纯化一个热稳定的酶可以使用高温使其他蛋白质变性后沉淀后收取上清夜,但是有些酶在低温下会解离而失活.还可能在低温下断开二硫键.

[ 本帖最后由 小裴2007 于 2008-1-31 20:08 编辑 ]
沙发
 楼主| 小裴2007 发表于 08-1-31 19:03:20 | 只看该作者
希望这里多一些具体专业问题的讨论,而不是仅仅发资料。
板凳
花仙子2008 发表于 08-1-31 19:05:20 | 只看该作者
这是个整理贴,希望一起思考和多多讨论。
地板
范老师 发表于 08-1-31 23:09:32 | 只看该作者
非常感谢你们能够为营造专业讨论学习的氛围作出贡献,这才是论坛的价值所在,那种成天下载资料的是不能够给大家带来真正的知识提高的,能够互相学习讨论彼此的知识,这才是真正的原创,谢谢你们[s:2]
5#
雨逸 发表于 08-2-1 17:35:30 | 只看该作者
高手就是与常人不同。
6#
 楼主| 小裴2007 发表于 08-2-21 23:17:10 | 只看该作者
大家应该多讨论问题!而不是仅仅找些资料!
7#
xuxusb 发表于 08-9-7 13:24:13 | 只看该作者
这个好~支持楼主
8#
romario0185 发表于 08-9-7 14:55:33 | 只看该作者
这才是真正的原创,谢谢你们[s:4]
9#
Tuexy 发表于 08-9-12 10:00:51 | 只看该作者

一个建议

上面的两位同志做了很好的领头工作。
如果真起把这个网站做成出色的考研论坛网,就当然要在上面进行各方面的讨论。
如果可以,我有这几个建议,请各位版主参考一下:
1、组织学习小组,小组成员内可以定学习计划;
2、设立考研提问格式,规范提问,并且要有保证机制使每一个提问都有人回答;
3、进行专题讨论(专题可包括研究热点和考试难点),把某一专题内的知识进行讨论;
4、提供各类专业课件,试频,动画的资源共享帖;
。。。。。。。

如果有管理员或版主注意到我的建议,并觉得有意义,请提升此帖,并与我和其它人发动进一步讨论。
谢谢
10#
xiaoxiongxiong 发表于 08-9-22 10:55:03 | 只看该作者
谢谢楼主了!楼主辛苦了
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